上海男科医院的排名因不同的评价标准而有所差异。根据多个因素的综合评价，以下是一些在上海地区较为知名的男科医院排名：

1. 上海交通大学医学院附属仁济医院东院。

2. 上海交通大学医学院附属第九人民医院泌尿外科。

3. 上海第一人民医院泌尿外科。此外，上海虹桥医院男科和上海九龙医院也是上海地区较为知名的男科医院。复旦中山医院男科和海军军医大学第二附属医院泌尿外科也是男性疾病患者的选择之一。因此，选择哪家医院应该结合患者的个人情况和需求综合考虑。另外，请注意这是一种参考性信息，具体的排名可能随着时间变化而发生变化。建议在决定就医前多方面了解和考察。